Heinolan lintuhoitolan keskeisenä toiminta-ajatuksena on hoitaa loukkaantuneita ja apua tarvitsevia luonnonvaraisia lintuja, sekä palauttaa ne kuntoutumisen jälkeen takaisin luontoon. Hoidettavien lintulajien joukossa on säännöllisesti uhanalaisia ja taantuneita lajeja, joten Heinolan lintuhoitola tukee toiminnallaan luonnonvaraisten lintulajien kantojen säilymistä ja monimuotoisuutta. 

Heinolan lintuhoitola hoitaa lakisääteistä tehtävää luonnonvaraisten eläinten hoidossa; luonnonvaraisten lintujen hoitoon tarvitaan viranomaisten ja eläinlääkärien lisäksi ensiapuun, hoitoon ja kuntoutukseen soveltuva paikka. Tässä Heinolan lintuhoitolalla on valtakunnallisesti merkittävä rooli Suomessa. Varsinaisen perustehtävän eli luonnonvaraisten lintujen hoitolatoiminnan lisäksi Heinolan lintuhoitolassa tehdään monipuolista luonto- ja ympäristökasvatusta sekä erilaisten yleisöopastusten että näyttelytilan lintuaiheisten näyttelyiden muodossa. 

Lintuhoitolan viiden työntekijän palkkakulut ja hoitolan muut kustannukset katetaan vuodessa noin 300 000 eurolla. Hoitolan ympärivuotinen toiminta on tällä hetkellä pääosin kaupungin avustusten varassa. Esimerkiksi vuodelle 2023 Heinolan lintuhoitolalle myönnettiin harkinnanvaraisen valtionavustuksen luonnonsuojelulain nojalla rauhoitettujen, vahingoittuneiden luonnonvaraisten eläinten hoitotoiminnan järjestämiseksi avustusta vain 60 000 euroa.