Valtion talousarvioesitykseen vuodelle 2016 ollaan liittämässä esitys, jonka perusteella ammattikorkeakouluindeksin vaikutusta ei huomioida vuosina 2016—2019. Tämän lisäksi vuonna 2016 toteutetaan hallitusohjelman mukaisesti 25 miljoonan euron pysyvä menosäästö korkeakoulujärjestelmän ja tutkimustoiminnan kustannustehokkuuden parantamisen ja hallinnon sekä korkeakouluverkon rationalisoinnin perusteella. 

Hallitusohjelmassa todetaan, että "rahoituksen vähennystä ei kuitenkaan tule kohdistaa sellaiseen toimintaan, mikä merkitsisi opetuksen ja tutkimuksen heikentymistä, vaan  erityisesti talous-, henkilöstö-, tieto- ja opetushallintoon." On kuitenkin selvää, että opetus ja tutkimus tulevat säästötoimien takia heikentymään. 

Jo tällä hetkellä hallinto kuormittaa opetus- ja tutkimushenkilöstöä. Hallintohenkilöstöä on jo karsittu runsaasti aiempina vuosina, ja lisäleikkaukset kohdistuvat väistämättä myös opetuksen, tutkimuksen ja kehittämistyön laatuun ja laajuuteen. Tätä kautta leikkaukset kohdistuvat myös opiskelijoihin, opetuksen tasoon ja tarjontaan sekä opintojen ohjaukseen ja muuhun opintoneuvontaan. 

Ammattikorkeakouluihin on jo edellisellä hallituskaudella kohdistettu mittavia leikkauksia. Leikkaukset johtivat ainakin 17 ammattikorkeakoulun YT-neuvotteluihin ja useisiin kymmeniin irtisanomisiin, lomautuksiin, määräaikaisten sopimusten päättämisiin, osa-aikaistamisiin ja muihin järjestelyihin. Monissa ammattikorkeakouluissa on edelleen menossa sopeuttamistoimenpiteitä, jotka ovat johtuneet näistä miljoonaluokan säästötarpeista. Leikkaukset merkitsevät todennäköisesti myös sitä, että korkeakoulujen toimipisteitä joudutaan karsimaan. Tämä taas vaikuttaa alueelliseen tasa-arvoon ja opintojen tarjontaan.